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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Soja. |
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Data corrente: |
19/05/2017 |
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Data da última atualização: |
05/07/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Orientação de Tese de Pós-Graduação |
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Autoria: |
CARVALHO, G. A. B. de. |
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Afiliação: |
GESIELE ALMEIDA BARROS DE CARVALHO, UEL. |
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Título: |
Análise transcricional dos genes envolvidos na nodulação e predição in silico de microRNAs em raízes de soja inoculadas com a estirpe CPAC 15 de Bradyrhizobium japonicum. |
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Ano de publicação: |
2012 |
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Fonte/Imprenta: |
2012. |
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Páginas: |
93 f. |
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Idioma: |
Português |
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Notas: |
Orientada por Mariangela Hungria. |
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Conteúdo: |
CONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defesa antioxidante. Funções putativas na simbiose de alguns desses genes foram atribuídas pela primeira vez na simbiose soja-Bradyrhizobium. Foi também realizada uma minuciosa predição in silico de miRNAs e seus alvos que, possivelmente, estão envolvidos na regulação da nodulação. Foram identificados nove miRNAs potenciais, bem como seus possíveis genes alvos. Os resultados obtidos permitiram obter um melhor entendimento sobre a regulação da expressão gênica em soja dez dias pós-inoculação, bem como fortaleceram a ideia de que a predição computacional de miRNAs pode auxiliar na compreensão das etapas iniciais da simbiose. O estudo é pioneiro com uma cultivar de soja e estirpe brasileiras. ABSTRACT: Abstract: Biological nitrogen fixation is a process of great importance to the soybean crop, capable of supplying all plant's needs on nitrogen, necessary for the synthesis of biomolecules. However, for nodule formation all steps should be closely coordinated by a series of molecular signals between the plant and bacterium. Therefore, the biological process involves several complex steps, and although it has been studied for several decades, much remains to be understood. This study aimed to analyze the global expression of genes differentially expressed in soybean roots of cultivar Conquista inoculated with Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (=SEMIA 5079), both broadly used in Brazil. In addition, we performed a computationally prediction of new miRNAs that may be involved in regulating the process. To achieve this we used the suppressive subtractive hybridization technique combined with the new generation sequencing and bioinformatics analyses, which resulted in a subtractive library (non-inoculated X inoculated) of soybean roots with 3,210 differentially expressed transcripts. The data were grouped according to the ontology of molecular function and biological process. Next, we analyzed the most active metabolic pathways at this stage of nodulation, and emphasis was given to genes related to the primary metabolism, cell wall modifications and antioxidant defense system. Putative functions were attributed to some of these genes for the first time. We have also performed a detailed in silico prediction of miRNAs and their targets, which are possibly involved in regulation of nodulation. Nine potential miRNAs were identified, as well as the possible target genes. The results obtained have allowed to get a better understanding about the regulation of gene expression in soybean ten days post-inoculation, as well as have reinforced the idea that the computational prediction of miRNAs may help to understand the initial steps of the symbiosis. Moreover, the study is pioneer with a Brazilian soybean cultivar and a Brazilian Bradyrhizobium strain. MenosCONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defes... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Fixação de nitrogênio; Soja. |
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Thesaurus Nal: |
Nitrogen fixation; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
S Ciências Biológicas |
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Marc: |
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520 $aCONTEUDO: A fixação biológica de nitrogênio é um processo de grande importância para a cultura da soja, capaz de suprir toda sua demanda de nitrogênio, necessário para a síntese de biomoléculas. Entretanto, para que os nódulos sejam formados todas as etapas devem ser estreitamente coordenadas por uma série de sinais moleculares entre a planta e a bactéria. Consequentemente, o processo envolve várias etapas complexas e, embora venha sendo estudado há várias décadas, ainda há muito para ser entendido. Este trabalho objetivou analisar a expressão global de genes expressos diferencialmente nas raízes de soja, cultivar Conquista, inoculadas com Bradyrhizobium japonicum estirpe CPAC 15 (=SEMIA 5079), ambas amplamente utilizadas no cultivo dessa leguminosa no Brasil. O estudo visou, ainda, predizer computacionalmente novos miRNAs que possam estar envolvidos na regulação da simbiose. Para atingir tal objetivo foi utilizada a técnica de hibridização subtrativa supressiva, combinada com o sequenciamento de nova geração e análises de bioinformática, o que resultou em uma biblioteca subtrativa (inoculadas X não-inoculadas) de raízes de soja com 3.210 transcritos diferencialmente expressos. Os dados foram analisados de acordo com as ontologias de função molecular e processo biológico. Em seguida, foram analisadas as vias metabólicas mais ativas nessa etapa da nodulação, e foram enfatizados genes relacionados ao metabolismo primário, às modificações da parede celular e ao sistema de defesa antioxidante. Funções putativas na simbiose de alguns desses genes foram atribuídas pela primeira vez na simbiose soja-Bradyrhizobium. Foi também realizada uma minuciosa predição in silico de miRNAs e seus alvos que, possivelmente, estão envolvidos na regulação da nodulação. Foram identificados nove miRNAs potenciais, bem como seus possíveis genes alvos. Os resultados obtidos permitiram obter um melhor entendimento sobre a regulação da expressão gênica em soja dez dias pós-inoculação, bem como fortaleceram a ideia de que a predição computacional de miRNAs pode auxiliar na compreensão das etapas iniciais da simbiose. O estudo é pioneiro com uma cultivar de soja e estirpe brasileiras. ABSTRACT: Abstract: Biological nitrogen fixation is a process of great importance to the soybean crop, capable of supplying all plant's needs on nitrogen, necessary for the synthesis of biomolecules. However, for nodule formation all steps should be closely coordinated by a series of molecular signals between the plant and bacterium. Therefore, the biological process involves several complex steps, and although it has been studied for several decades, much remains to be understood. This study aimed to analyze the global expression of genes differentially expressed in soybean roots of cultivar Conquista inoculated with Bradyrhizobium japonicum strain CPAC 15 (=SEMIA 5079), both broadly used in Brazil. In addition, we performed a computationally prediction of new miRNAs that may be involved in regulating the process. To achieve this we used the suppressive subtractive hybridization technique combined with the new generation sequencing and bioinformatics analyses, which resulted in a subtractive library (non-inoculated X inoculated) of soybean roots with 3,210 differentially expressed transcripts. The data were grouped according to the ontology of molecular function and biological process. Next, we analyzed the most active metabolic pathways at this stage of nodulation, and emphasis was given to genes related to the primary metabolism, cell wall modifications and antioxidant defense system. Putative functions were attributed to some of these genes for the first time. We have also performed a detailed in silico prediction of miRNAs and their targets, which are possibly involved in regulation of nodulation. Nine potential miRNAs were identified, as well as the possible target genes. The results obtained have allowed to get a better understanding about the regulation of gene expression in soybean ten days post-inoculation, as well as have reinforced the idea that the computational prediction of miRNAs may help to understand the initial steps of the symbiosis. Moreover, the study is pioneer with a Brazilian soybean cultivar and a Brazilian Bradyrhizobium strain.
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650 $aSoybeans
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650 $aSoja
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Registro original: |
Embrapa Soja (CNPSO) |
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| Registros recuperados : 32 | |
| 3. |  | CRUZ, E. S. da; RITZINGER, R. Vingamento de frutos em cruzamentos controlados de aceroleira. In: REUNIÃO ANUAL DE CIÊNCIA, TECNOLOGIA, INOVAÇÃO E CULTURA NO RECÔNCAVO DA BAHIA - RECITEC RECÔNCAVO. 1., 2011, Cruz das Almas. Anais... Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2011. 1 CD-ROM. 2 p. Em paralelo aconteceram também os seguintes eventos: V Seminário de Pesquisa do Recôncavo da Bahia; V Seminário Estudantil de Pesquisa da UFRB; V Seminário da Pós-Graduação da UFRB; II Seminário Regional de Pesquisa da EBDA; 5ª Jornada...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 6. | | VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; CRUZ, E. S. da; LUQUINE, L. S.; JESUS, F. N. de. Avaliação do peso de frutos de acerola em híbridos do cruzamento “Okinawa” x “Sertaneja”. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). PDF 142.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 9. | | SANTOS, J. F. dos; RITZINGER, R.; LUQUINE, L. S.; VIEIRA, R. S.; CRUZ, E. S. da. Avaliação de genótipos de aceroleira na Embrapa Mandioca e Fruticultura Tropical. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). PDF 131.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 12. | | LUQUINE, L. S.; RITZINGER, R.; VIEIRA, R. S.; CRUZ, E. S. da; SANTOS, J. F. dos. Efeito de resíduos orgânicos nos atributos químicos do solo em cultivo de aceroleira. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 3.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA DA UFRB, 3.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 3., 2009, Cruz das Almas. Evolução do conhecimento e o desenvolvimento social: [resumos...]. Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 13. | | SOARES FILHO, W. dos S.; RITZINGER, R.; SANTANA, I. B. B.; CRUZ, E. S. da. Pré-melhoramento genético de umbu-cajazeira. In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS, 2., 2008, Brasília, DF. Anais... Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2008. p. 461.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 14. | | LUQUINE, L. S.; RITZINGER, R.; RITZINGER, C. H. S. P.; VIEIRA, R. S.; CRUZ, E. S. da. Avaliação de genótipos de aceroleira adubados com urina de vaca, torta de mamona e manipueira. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 2.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA DA UFRB, 2.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 2., 2008, Cruz das Almas, BA. Sustentabilidade ambiental e qualidade de vida. Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2008.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 16. | | TOYOSUM, I.; AMORIM, M. da S.; COSTA, M. G. C; COELHO FILHO, M. A.; LOPES, W.; CRUZ, E. S. da. Atividade: produtividade de laranjeira "pera" Enxertada em limoeiro `cravo` sob diferentes Manejos de irrigação no litoral norte da bahia. In: REUNIÃO ANUAL DE CIÊNCIA, TECNOLOGIA, INOVAÇÃO E CULTURA NO RECÔNCAVO DA BAHIA - RECONCITEC, 4. 2017, Cruz das Almas. Educação, desenvolvimento e integração Social: anais.... Cruz das Almas, Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2017. 1 p.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 17. | | CRUZ, E. S. da; VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; SOARES FILHO, W. dos S.; LEDO, C. A. da S. Características da inflorescência em umbu-cajazeira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE RECURSOS GENÉTICOS; WORKSHOP EM BIOPROSPECÇÃO E CONSERVAÇÃO DE PLANTAS NATIVAS DO SEMI-ÁRIDO, 3.; WORKSHOP INTERNACIONAL SOBRE BIOENERGIA E MEIO AMBIENTE, 2010, Salvador. Bancos de germoplasma: descobrir a riqueza, garantir o futuro: anais. Brasília, DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2010. 1 CD-ROM (Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. Documentos, 304). PDF 171| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 18. | | VIEIRA, R. S.; RITZINGER, R.; LEDO, C. A. da S.; LUQUINE, L. S.; CRUZ, E. S. da; SANTOS, J. F. dos. Avaliação de variedades de aceroleira mediante análise multivariada. In: SEMINÁRIO DE PESQUISA DO RECÔNCAVO DA BAHIA, 3.; SEMINÁRIO ESTUDANTIL DE PESQUISA DA UFRB, 3.; SEMINÁRIO DE PÓS-GRADUAÇÃO DA UFRB, 3., 2009, Cruz das Almas. Evolução do conhecimento e o desenvolvimento social: [resumos...]. Cruz das Almas: Universidade Federal do Recôncavo da Bahia, 2009. 1 CD-ROM.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Mandioca e Fruticultura. |
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| 19. | | SANTANA, I. B. B.; SOARES FILHO, W. dos S.; RITZINGER, R.; AMORIM, E. P.; COSTA, M. A. P. de C.; CRUZ, E. S. da; LUQUINE, L. S. Análise conjunta de caracteres quantitativos e qualitativos em acessos de umbu-cajazeira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. 1 CD-ROM. pdf 598| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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| 20. | | SANTOS, J. F. dos; RITZINGER, C. H. S. P.; RITZINGER, R.; LUQUINE, L. S.; CRUZ, E. S. da; LEDO, C. A. da S. Avaliação do efeito nematicida e/ou fertilizante de diferentes concentrações de torta de dendê em mudas de bananeira. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE FRUTICULTURA, 21., 2010, Natal. Frutas: saúde, inovação e responsabilidade: anais. Natal: Sociedade Brasileira de Fruticultura, 2010. pdf 1664| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
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